【檢(jian)驗原理(li)】
本試(shi)劑盒(he)針對小反(fan)芻獸疫病毒的高度保守區域設計特異性引(yin)物和探(tan)針,在反(fan)應體系中含小反(fan)芻獸疫病毒基因組(zu)模板(ban)的情況(kuang)下,PCR反應得以進行并釋放熒光信號。利用熒光定量PCR儀對PCR過程中相應通道信號進行實時監測和輸出,實現檢測結果的定性分析。
【主要組(zu)成(cheng)(cheng)成(cheng)(cheng)份(fen)】
序號 | 組成 | 25T/盒 | 50T/盒(he) |
1 | PPRV RT-PCR反應液(ye) | 437.5 μL×1管 | 875 μL×1管 |
2 | PPRV 混合酶液 | 62.5 μL×1管(guan) | 125 μL×1管(guan) |
3 | PPRV 陽性對照(zhao) | 40 μL×1管 | 40 μL×1管 |
4 | PPRV 陰性對照(zhao) | 40 μL×1管 | 40 μL×1管 |
5 | 說明書(shu) | 1份 | 1份(fen) |
注(zhu):陰(yin)性對照為偶(ou)蹄獸類基因組DNA,陽性對照為失去活性的小(xiao)反芻獸疫病毒cDNA。
【儲存(cun)條(tiao)件(jian)及(ji)有(you)效期】避光-20℃以下保存,避免反復凍融,有效期12個月。
【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列 、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等(deng)多通道實時熒光(guang)定量PCR儀。
【樣本要(yao)求(qiu)】
1. 適(shi)用標本類型:發(fa)病動物血液、空腸(chang)(chang)及小腸(chang)(chang)腸(chang)(chang)內容(rong)物及組織(zhi)臟器(腸道組織、腸系膜及淋巴結等)和病毒培養液。
2. 標本采集,方法如下:
(1) 血清:用一次(ci)性注射(she)器取靜脈血2-3ml,轉(zhuan)至5ml 的干燥管中(zhong),密閉送檢。
(2) 腸內容物:無菌(jun)條件下(xia)取腸道內容物約1g 左右,置入1ml 含有1.0ml PBS(或生理(li)鹽水)的5ml 離心(xin)管(guan)中(zhong),立即(ji)送(song)檢。
(3) 組(zu)織臟器:取發病動物腸道組(zu)織及(ji)腸系膜(mo)淋巴結(jie)等(deng)組(zu)織約1g,置(zhi)一1.5ml的潔凈離心(xin)管(guan)中(zhong),密(mi)閉(bi)送檢。
3.應避免標本(ben)間交(jiao)叉污(wu)染。
4.標(biao)本收集(ji)后可立即檢測;若不能(neng)立即檢測,可置于2~8℃冷藏(zang)過(guo)夜保存;如(ru)需長期保存,標本應凍存(cun)于-80℃以下,避免反復凍融。
【檢驗方法】
1. 試劑(ji)準(zhun)備(試劑(ji)準(zhun)備區)
(1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時離心以去除管壁附著液體。
(2)核算當次實驗所需要的反應數(n),并根據如下表所示反應體系計算當次實驗所需要的各種試劑量。
n =陰(yin)性(xing)對照數(shu)(1T)+陽(yang)性(xing)對照數(shu)(1T)+誤(wu)差(cha)預(yu)留量(1T)+樣本(ben)數(shu)
單反液配(pei)制表 | RT-PCR反應液 | 17.5 μL |
混合酶液 | 2.5 μL |
(3)在無菌離心(xin)管(guan)中加入上述試劑,充分混(hun)勻后瞬時(shi)離心(xin)。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應管。
2.樣本(ben)準備(樣本(ben)處(chu)理(li)區)
用QIAGEN、Roche公司(si)RNA提(ti)取(qu)試劑(ji)盒(he)提(ti)取(qu)RNA,具體操作(zuo)按照其試劑(ji)盒(he)說明書(shu)操作(zuo)。
3.加樣
在(zai)上述制備(bei)好(hao)的PCR反應樣本管中分別加入處理好的待測標本RNA各5 μl、終體積25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉移到PCR儀器上。陰性對照和陽性對照管則各加5 μL試劑盒自帶的陰性對照或陽性對照品,終體積為25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉移到PCR儀器上。
4. PCR(PCR擴(kuo)增區)
(1)取樣本處理區準備好的PCR反應管,放置在實時熒光定量PCR儀樣品槽相應位置,并記錄放置順序。
(2)按下表設置儀器核酸擴增相關參數進行PCR擴增。
反應體積 | 25 μL | 通道選擇 | FAM通道采集小反芻(chu)獸疫(yi)病毒熒光信號 |
PCR 反應 條件(jian) | 步驟(zou) | 條件(jian) | 循環數 |
反轉錄 | 50℃:10分鐘(zhong)(min) | 1 | |
預(yu)變性 | 95℃:3分(fen)鐘(min) | 1 | |
PCR擴(kuo)增(zeng) | 95℃:5秒(s) | 40 | |
55℃:40秒(s) (此(ci)階段結(jie)束時采(cai)集熒(ying)光信號) |
注:ABI系列熒光PCR儀在設置時不選ROX校正,設置淬滅基團選擇None。
【參考(kao)值(參考(kao)范圍(wei))】
1.試劑盒有效性判(pan)定:
(1)陽性對照:有典型S型擴增曲線或Ct值≤35。
(2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數增長期。
2.標本結果判定:
(1)陽性:標本(ben)檢測結果Ct值≤35或有明顯指數增長期。
(2)可(ke)疑:標本檢測(ce)結果Ct值在(zai)35~38范(fan)圍內(nei)。此時(shi)應對標本(ben)進行重復檢測(ce),如重復實驗結(jie)果(guo)Ct值仍在(zai)35~38范(fan)圍內(nei),有明顯指數增長期,則(ze)判定為陽性,否則(ze)為陰性。
(3)陰性:標本檢(jian)測結果Ct值>38或無Ct值。
【檢驗結果的解釋】
通道及檢測結果(guo) | 標本檢測結(jie)果解釋 |
FAM | |
陽性(xing)(+) | 標本(ben)中檢出小(xiao)反芻獸疫病毒RNA |
陰(yin)性(-) | 標本中(zhong)未檢出小反芻(chu)獸疫病毒RNA |
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