預期用途】
口蹄疫病毒(Foot and Mouth Disease Virus,FMDV) 屬于小RNA病毒科,口(kou)蹄疫病毒屬,主要侵害偶蹄獸,有O、A、C、SAT1、SAT2、SAT3和Asia-I七個血清型。口蹄疫發病(bing)以(yi)發(fa)熱、口腔黏膜及蹄(ti)部(bu)和乳房皮(pi)膚發(fa)生水泡和潰爛為(wei)特征,是國際獸疫局規定的A類傳染病,易通過空氣傳播,傳染性強,流行迅速,偶爾感染人。由于口(kou)蹄疫傳播迅速、難于防治、補救措施少,被稱為畜牧業的“頭號殺手"。
本試劑(ji)盒利用實(shi)時熒(ying)光PCR原理(li),定性檢測口蹄(ti)疫O型病毒(FMDV-O),對FMDV-O引起的偶蹄獸類病的診(zhen)斷和監控具有重要(yao)指導意義(yi)。
【檢驗(yan)原(yuan)理】
本(ben)試(shi)劑盒針(zhen)對口(kou)蹄疫病(bing)毒O型的高度(du)保守區域設計特異性引物和探針,在反應體系中含口蹄疫病毒O型基因組(zu)模板的情(qing)況(kuang)下,PCR反應得以進行并釋放熒光信號。利用熒光定量PCR儀對PCR過程中相應通道信號進行實時監測和輸出,實現檢測結果的定性分析。
【主(zhu)要組成成份】
序號 | 組成 | 25T/盒 | 50T/盒 |
1 | FMDV-O RT-PCR反應液 | 375 μL×1管(guan) | 750 μL×1管 |
2 | FMDV-O逆轉錄酶 | 50 μL×1管 | 100 μL×1管 |
3 | FMDV-O Taq酶 | 75 μL×1管 | 150 μL×1管 |
4 | FMDV-O陽性(xing)對照 | 40 μL×1管 | 40 μL×1管 |
5 | FMDV-O陰(yin)性對(dui)照 | 40 μL×1管 | 40 μL×1管 |
6 | 說明(ming)書 | 1份(fen) | 1份 |
注:陰性對照為偶蹄(ti)獸類基因(yin)組DNA,陽性對照為失去活性的FMDV-O病毒cDNA。
【儲存條件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反復凍融,有效期12個月。
【適(shi)用儀器(qi)】ABI 系(xi)(xi)(xi)列(lie)(lie)、Bio-Rad系(xi)(xi)(xi)列(lie)(lie)、Agilent Stratagene MX系(xi)(xi)(xi)列(lie)(lie) 、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系(xi)(xi)(xi)列(lie)(lie)、杭州博(bo)日系(xi)(xi)(xi)列(lie)(lie)等多通道實(shi)時(shi)熒光(guang)定量PCR儀(yi)。
【樣本要求】
新鮮采(cai)集的咽拭子、皰疹液(ye)和(he)糞便標本(ben),并使用滅菌生理鹽水(shui)懸浮。
2.應避免標本間交叉污染。
3.標本(ben)收集后可立即檢測;若不能立即(ji)檢測,可(ke)置于2~8℃冷(leng)藏過(guo)夜(ye)保存(cun)(cun);如需(xu)長期保存(cun)(cun),標本應凍存于-80℃以(yi)下(xia),避免反復凍(dong)融(rong)。
【檢驗方法】
1. 試(shi)(shi)劑準(zhun)備(試(shi)(shi)劑準(zhun)備區)
(1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時離心以去除管壁附著液體。
(2)核算當次實驗所需要的反應數(n),并根據如下表所示反應體系計算當次實驗所需要的各種試劑量。
n =陰性對照(zhao)數(1T)+陽性對照(zhao)數(1T)+誤(wu)差(cha)預留量(1T)+樣本(ben)數
單(dan)反液配制表(每份) | RT-PCR反應(ying)液(ye) | 15.0 μL |
逆轉錄酶 | 2.0 μL | |
Taq酶 | 3.0 μL |
(3)在無(wu)菌離(li)心管中加入(ru)上述試(shi)劑,充分混勻后瞬時離(li)心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應管。
2.樣(yang)本(ben)準備(樣(yang)本(ben)處理區)
用QIAGEN、Roche公司RNA提取試劑盒提取RNA,具體操作按照其試劑盒說明書操作。
3.加樣(yang)
在上(shang)述制備好的PCR反應樣本管中分別加入處理好的待測標本RNA各5 μl、終體積25 μl/管(guan),蓋好PCR反應蓋混(hun)勻(yun)后瞬(shun)時低速(su)離(li)心,轉(zhuan)移(yi)到PCR儀(yi)器上(shang)。陰(yin)性對照(zhao)(zhao)和陽(yang)性對照(zhao)(zhao)管(guan)則(ze)各加5 μL試劑盒自帶(dai)的陰性對(dui)照(zhao)或陽性對(dui)照(zhao)品,終體積為25 μl/管,蓋(gai)好PCR反應蓋(gai)混(hun)勻(yun)后瞬時低速離心(xin),轉移(yi)到PCR儀器上。
4. PCR(PCR擴(kuo)增區)
(1)取樣本處理區準備好的PCR反應管,放置在實時熒光定量PCR儀樣品槽相應位置,并記錄放置順序。
(2)按下表設置儀器核酸擴增相關參數進行PCR擴增。
反應(ying)體(ti)積(ji) | 25 μL | 通道選擇(ze) | FAM通道采集(ji) FMDV-O病毒熒光(guang)信號(hao) |
PCR 反應 條件 | 步驟 | 條件 | 循環數(shu) |
反轉錄(lu) | 42℃:10分鐘(min) | 1 | |
預變(bian)性 | 95℃:3分鐘(min) | 1 | |
預(yu)擴增 | 95℃:5秒(miao)(s) | 5 | |
55℃:40秒(s) | |||
PCR擴增(zeng) | 95℃:5秒(s) | 40 | |
55℃:40秒(s) (此階段結束時采(cai)集熒光信號(hao)) |
注:ABI系列熒光PCR儀在設置時不選ROX校正,設置淬滅基團選擇None。
【參(can)(can)考(kao)值(參(can)(can)考(kao)范(fan)圍)】
1.試(shi)劑(ji)盒有效性(xing)判定:
(1)陽性對照:有典型S型擴增曲線或Ct值≤35。
(2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數增長期。
2.標(biao)本結果判(pan)定:
(1)陽性:標本檢測結果Ct值≤35或有明顯指數增長期。
(2)可疑:標本檢測(ce)結果Ct值在35~38范(fan)圍內。此時應對標本進行重復檢(jian)測,如重復實驗(yan)結果Ct值仍在35~38范圍內,有明顯(xian)指(zhi)數增長(chang)期,則判(pan)定為陽(yang)性,否則為陰性。
(3)陰性:標(biao)本檢測(ce)結果(guo)Ct值>38或無Ct值。
【檢驗結果的解釋】
通道(dao)及(ji)檢測結果 | 標(biao)本檢測結果解釋 |
FAM | |
陽性(+) | 標(biao)本中檢出FMDV-O病毒RNA |
陰性(-) | 標本中未檢出FMDV-O病毒RNA |
【檢驗方法的局限性(xing)】
1. 當檢測(ce)樣(yang)本中(zhong)被(bei)檢核酸濃(nong)度低于本試劑(ji)盒的檢出可能會發生(sheng)假(jia)陰性的結(jie)果。
2. 被檢樣本在采集、運輸(shu)、儲存以(yi)及處理過程中操(cao)作方式不當容易造成RNA降解而產生假陰性結果。
3. 樣本(ben)在采(cai)集、運輸、儲(chu)存(cun)以及處理(li)過程中(zhong)發生(sheng)交(jiao)叉(cha)污染(ran),則(ze)容易得到假陽性結果(guo)。
【產(chan)品性能指(zhi)標】 產(chan)品的(de)檢出限為102 Copies/mL,產品CV值≤5%。
【注意事項】
1. 整個(ge)檢測(ce)過程應嚴(yan)格按照本(ben)(ben)說明書(shu)要求分別在試劑(ji)準備區、樣本(ben)(ben)處(chu)理區和PCR擴增(zeng)區(qu)(qu)進(jin)行操作(zuo),各區(qu)(qu)實(shi)驗(yan)服、儀器(qi)、耗材應(ying)獨立使用(yong),不(bu)能混用(yong);實(shi)驗(yan)用(yong)吸頭采用(yong)帶濾芯吸頭;樣(yang)本處(chu)理區(qu)(qu)應(ying)配有生物安(an)全(quan)柜,樣(yang)本處(chu)理在生物安(an)全(quan)柜中進(jin)行操作(zuo);三個區(qu)(qu)應(ying)該配有紫外線殺菌裝(zhuang)置。
2. 為(wei)避(bi)免RNA降(jiang)解,樣本(ben)處理過程應在0-4℃條件(jian)下操作,且完成實驗后(hou)立即上機(ji)檢測;樣本處理過(guo)程(cheng)中使用的器(qi)具耗材應經過(guo)無(wu)核酶處理。
3. 每次實驗(yan)應該設(she)置陰、陽(yang)性對(dui)照。
4. 試劑盒所有試劑在使用前應(ying)(ying)該(gai)在常溫(wen)下充分(fen)融(rong)化(hua)混勻,并應(ying)(ying)瞬時(shi)離(li)心。
5. 試劑盒內所(suo)配陰(yin)性(xing)和陽(yang)性(xing)對照在第一次使用前應全部轉移(yi)至標本準備(bei)區,并單(dan)獨存放。
6. 為防止(zhi)熒光干(gan)擾(rao),應避免裸手直接接觸PCR反應管,并應避免(mian)在PCR反應管上(shang)進行任(ren)何標記。
7. 儀(yi)器擴增相關參數應按照本(ben)說明(ming)書相關要求進行設(she)置;不同批號試劑(ji)不能混用。
8. ABI系列熒光定量PCR儀參數設置中不選ROX校正,淬滅(mie)基因選擇None。
9. 實驗過程中產(chan)品的(de)廢(fei)棄物應該進行無害化處理后方可丟棄。